C'est la plus ancienne des 4 îles des Comores, elle culmine à 660m. La végétation fortement dégradée conserve néanmoins des joyaux tels que forêt humide et forêt sèche endémique. Les côtes sont très découpées et diversifiées : mangroves, plages coralliennes ou basaltiques, caps et presqu’îles, récifs coralliens frangeant omniprésents...
Mayotte possède le second plus vaste lagon du monde : délimité par une barrière récifale de 180 km de long qui atteint 4km de large, il couvre 1 200 km² et sa profondeur moyenne est de 30m.
L'archipel abrite une biodiversité marine d'intérêt international, il s'agit entre autre d'un haut lieu d'observation pour les tortues et les mammifères marins.
Pour faire face aux enjeux de préservation de la biodiversité à Mayotte, plusieurs acteurs se mobilisent. Ce sont ces acteurs qui sont soutenus par Te Me Um et qui, chaque année, font remonter leurs besoins en terme de renforcement de capacité.